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今朝、定期的なパスワード変更後、再度ログインしようとしたら、セキュリティキーの設定を促す表示になり、ログイン出来なくなってしまいました。こちらでも同様の問い合わせがありましたが、端末側の問題だから、メーカーに問い合わせしなさいなどとの返答がなされておりましたが、LINE WORKSのヘルプデスクに確認した所、

【利用されている会社のLINE WORKS管理者がログイン出来る管理サイト上で、当該利用者の「認証済みの端末」を一旦、削除し、再度ログイン】

を試みると、通常通りパスワードを要求される画面に切り替わり、ログイン出来ました。
ヘルプデスクの方によると、アンドロイドOSの問題なのか、機種個体（今回はGalaxy S9)のアップデートなどによるものなのかは分からないとの事でした。
下記に手順を記しておきます。